CNG ana istasyonlarının yer seçimi konusunda, bunların yerleşik kentsel gelişim bölgeleri içerisinde konumlandırılması önerilmez ve şehir merkezleri içerisinde yer almamalıdır. İstasyon binaları içerisinde tek şeritli veya bireysel araç park yerlerinin genişliği 4,5 metreden az olmayacak ve yol yüzey kaplaması asfalttan oluşmayacaktır.
CNG ana istasyonları, yanıcı ve patlayıcı maddeler içeren-yüksek basınçlı ortamlar olduğundan, bunların güvenli operasyonel yönetimi büyük önem taşımaktadır. Depolama silindiri sıraları (veya depolama kuyuları) ile yakıt püskürtme memeleri arasına bir dizi valf (özellikle bir depolama silindiri kümesi (veya depolama kuyusu) kapatma-kapama valfi, bir ana kapatma-kapama valfi, bir acil durum kapatma-kapama valfi ve bir yakıt doldurma-kapatma valfi- takılmalıdır. İstasyonun proses sistemleri, giriş güvenliği kapatma sistemi-ve istasyon çapında kapsamlı bir güvenlik izleme sistemi-gibi entegre özellikleri içerir. Depolama tesisleri, her biri en az 35 kg kapasiteli, arabaya monte edilmiş en az iki kuru tozlu yangın söndürücüyle donatılmalıdır; ayrıca yıldırımdan korunma sisteminin topraklama direnci 10Ω'u geçmeyecektir.
Yanıcı gaz alarmları ve kapatma cihazlarından oluşan PLC-kontrollü bir sistemle birlikte istasyonun her yerine yanıcı gaz dedektörleri kurulmalı-; bu sistem istasyonun güç kaynağı ve gaz besleme sistemleri ile bir kilitleme ilişkisi kurar.
Kapsamlı ekipman yelpazesi, yüksek düzeyde otomasyon ve tesisin yanıcı ve patlayıcı maddeler içeren yüksek-basınçlı bir ortam olarak doğası göz önüne alındığında, güvenli operasyonel yönetim kritik öneme sahiptir.

